华电新疆发电有限公司是集团公司全资子公司，成立于2003年3月，代表集团公司行使区域管理职能，负责新疆区域项目发展、工程建设、经营管理、党的建设、队伍建设等工作。新疆公司现管理企业32家，资产总额超过950亿元，装机容量2476.8万千瓦（火电装机1474.4万千瓦，清洁能源装机1002.4万千瓦），承担1.85亿平方米、占全疆近30%集中供热保障任务，是新疆集“风光水火储煤”多种能源协同发展的最大能源发电企业。